Нельзя использовать Яндекс.Диск для синхронизации библиотеки FCPX. Только для резервных копий или материала.

На сегодня Яндекс.Диск версии 3.1.21 (последняя на 15 сентября 2020 года) плохо работает с часто меняющимся контентом.

Если в папку диска положить библиотеку, гарантировано будет появляться следующее сообщение:

The storage location for one or more libraries is no longer available. The libraries will be closed so that no work is lost.

А сами данные теряться. Проверено неоднократно. Бэкапы спасут, но зачем оно? Так что, пока библиотеку выносим в другое место.